Устойчивость экосистемы понимают как проявление гомеостатических свойств в условиях внешнего возмущения. Устойчивость обеспечивается сложным системным саморегулированием, в котором процессы эволюции играют ведущую роль: для сохранения устойчивости экосистема должна постоянно изменяться - эволюционировать. Для многих экосистем характерна смена фаз развития (сукцессия), знание которых позволяет в некоторых случаях замедлять или ускорять прохождение экосистемой той или иной фазы. Экосистемы нередко ведут себя вероятностным образом, что делает прогноз их изменений сложной научной задачей, а управление экосистемами скорее надеждой, чем обоснованными планами. Вместе с тем возможна успешная реставрация ряда экосистем.