Для Юга Сибири характерно наличие значительного числа природных очагов опасных для человека болезней. Это клещевой энцефалит, туляремия, клещевой тиф, Кулихорадка, пастереллез, эризипелоид и др. (Некипелов и др. 1965). Наиболее опасны и широко распространены энцефалит и туляремия.
Энцефалит связан с иксодовыми клещами, в массе появляющимися в южной тайге в апреле — мае, когда стаивает снег. Севернее, в среднетаежных лесах, энцефалит почти не встречается, Иксодовые клещи имеют сложный цикл развития, длящийся от 3 до 5 лет. Личинки и нимфы клещей нападают на мелких лесных млекопитающих и птиц и питаются их кровью. Здесь возможна передача вируса, в результате в природе поддерживаются и функционируют очаги клещевого энцефалита.
Туляремия распространена по всему региону, но более всего приурочена к зоне лесостепи и обычна там, где обильны водоемы, болота и заболоченные луга. Природные очаги туляремии связаны со многими видами грызунов и главным образом с водяной крысой.