Наряду с зоогеографическим делением суши выделяют отдельные фаунистические области в пределах Мирового океана. В прибрежной зоне моря, помимо мелководья, различают зону открытого моря и глубоководную зону. В каждой из них можно выделить различные фаунистические регионы и их подразделения. Прибрежную фауну, связанную с морским шельфом и поэтому сильнее расчлененную (поскольку ее распространение ограничивается как материками, так и широкими океанскими просторами), принято подразделять на три области: Тропическую, Северную и Южную.
Тропическая область разделяется следующим образом: 1) Индийско-западнотихоокеанская подобласть, включающая Малайский, Южноцентральнотихоокеанский, Гавайский, Южнояпонский, Североавстралийский и Индийский округа; 2) Восгочнотихоокеанская подобласть; 3) Западноатланти-ческая подобласть; 4) Восточноатлантическая подобласть. Для этой области характерны уже подробно описанные коралловые рифы. Следует все же упомянуть о многочисленных «коралловых рыбах», относящихся к различным семействам, таким, как щетинозубые (Chaetodontidae), рифовые (Pomacentridae), рыбы-попугаи (Scaridae), каменные окуни (Serranidae) и губановые (Labridae).
На целый ряд подобластей делят Северную и Южную области. В Северной это - Средиземноморско-атлантическая, Сарматская, Атлантическо-бореальная, Балтийская, Северотихоокеанская и Арктическая; в Южной-Южноафриканская, Южноавстралийская, Перуанская, Южноамериканская и Кергеленская. Влияние температуры и других факторов среды на распространение животных, приспособленных к жизни в открытом море, сказывается сильнее, чем на прибрежной фауне. Фауна глубоководной зоны (абиссали) тоже подразделяется в соответствии с глубинами. Например, весьма своеобразен мир океанских котловин и впадин. В открытом море в соответствии с географическим положением обычно различают следующие подобласти: Арктическую, Атлантическую, Индийско-тихоокеанскую и Антарктическую.